刺五加法尼基焦磷酸合酶基因的克隆、生物信息学及表达分析(1)
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[摘要]目的：克隆刺五加的法尼基焦磷酸合酶(farnesyl diphosphate synthase，FPS)基因，并对其进行生物信息学和表达分析。方法：采用cDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends， RACE)技术克隆刺五加FPS基因的全长cDNA序列。运用生物信息学方法对该基因进行分析，预测其编码蛋白的结构与功能。并通过RTPCR法检测FPS在不同器官中的表达情况。结果：刺五加FPS基因的cDNA全长为1 499 bp， 开放阅读框长1 029 bp，编码342 个氨基酸的蛋白，包含2个富含天冬氨酸 (DDXXD)的保守功能域。FPS蛋白无跨膜区域，定位于细胞质中。RTPCR的结果显示，刺五加FPS基因在各器官中均有表达，但表达量具有显著差异(P<0.05)。结论：首次分离并报道了刺五加FPS的cDNA 克隆， 并证实其在不同器官中的表达量不同，为进一步研究FPS对刺五加皂苷合成的影响和表达调控奠定了基础。
[关键词]刺五加；法尼基焦磷酸合酶；克隆；表达分析
[稿件编号]20111204004
[基金项目]国家自然科学基金项目(30701086)；河北省自然科学基金项目(C2009001252)；河北省自然科学基金石药集团医药联合基金项目(H2012401006)
[通信作者]*邢朝斌，副教授，研究方向为分子生药学、药用植物细胞工程，Tel： (0315)3726238，Fax：(0315)3726341，Email： xingzhaobin@yahoo ......
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