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编号:12635847
丹参类贝壳杉烯氧化酶(SmKOL)基因全长克隆及其生物信息学分析(3)
http://www.100md.com 2014年11月1日 中国中药杂志 2014年第21期
     3.3 理化性质和3D结构预测 使用ExPASy在线服务器的Compute pI/Mw工具预测,SmKOL蛋白的相对分子质量为58.88 kDa,等电点pI 7.62。亚细胞定位结果表明可能定位于细胞质或者细胞核。信号肽分析表明为分泌蛋白,前23个氨基酸可能是信号肽,跨膜域分析可能为膜蛋白。SmKOL蛋白的二级结构预测结果显示,α螺旋结构占50.10%、β折叠结构占6.36%、无规则卷曲结构占43.55%。蛋白质的功能很大程度上取决于其空间结构,无规则卷曲结构决定了蛋白质,尤其是酶的功能部位常常位于这种构象区域,而α螺旋主要对蛋白质骨架起稳定作用,通过对蛋白质二级与三级结构预测和分析,有助于理解蛋白质功能与结构的关系[10]。使用Swiss Model进行同源建模,以人Cytochrome P450 2R1蛋白A链(PDB注册号3czh.1.A)作为同源模板 ......
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