基于UPLCQTOF/MS的植物代谢组学技术鉴别林下山参的生长年限(2)
2.4 数据处理与分析
将采集到的原始质谱数据利用MassLynx V4.1软件进行峰提取、峰匹配、峰对齐、峰识别以及归一化等预处理，导出由样品名称、保留时间、质荷比、以及对应的离子强度组成的数据集。其主要参数设置如下：保留时间范围为1～25 min；质荷比范围为100～1 500；保留时间和质荷比允许偏差分别为0.2 min，0.05；噪音消除水平为6；响应强度阈值为500 counts；去除同位素峰。
导出的数据集按照80%规则去除零值[19]，并经次方转换(power transformation)、Pareto标度化处理后使用SIMCAP+13.0(Umetrics AB， Umea， 瑞典)软件进行PCA，OPLSDA等多变量统计分析。通过变量权重重要性排序(variable importance in the projection，VIP)值筛选对分类贡献大的差异代谢物，再利用筛选的差异代谢物建立11～15年林下山参的OPLSDA判别模型，并采用7倍交叉验证(7fold cross validation)和置换检验(permutation test)对模型进行验证。
3 结果
3.1 不同生长年限的林下山参UPLCQTOF/MS图谱分析
根据液相色谱及质谱分析条件 ......
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将采集到的原始质谱数据利用MassLynx V4.1软件进行峰提取、峰匹配、峰对齐、峰识别以及归一化等预处理，导出由样品名称、保留时间、质荷比、以及对应的离子强度组成的数据集。其主要参数设置如下：保留时间范围为1～25 min；质荷比范围为100～1 500；保留时间和质荷比允许偏差分别为0.2 min，0.05；噪音消除水平为6；响应强度阈值为500 counts；去除同位素峰。
导出的数据集按照80%规则去除零值[19]，并经次方转换(power transformation)、Pareto标度化处理后使用SIMCAP+13.0(Umetrics AB， Umea， 瑞典)软件进行PCA，OPLSDA等多变量统计分析。通过变量权重重要性排序(variable importance in the projection，VIP)值筛选对分类贡献大的差异代谢物，再利用筛选的差异代谢物建立11～15年林下山参的OPLSDA判别模型，并采用7倍交叉验证(7fold cross validation)和置换检验(permutation test)对模型进行验证。
3 结果
3.1 不同生长年限的林下山参UPLCQTOF/MS图谱分析
根据液相色谱及质谱分析条件 ......
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